有性生殖中，精子和卵子也稱(chēng)配子，相對(duì)于配子而言，受精卵就是合子。對(duì)二倍體動(dòng)物斑馬魚(yú)而言，合子基因組的核遺傳物質(zhì)中一套染色體來(lái)自母親，另一套來(lái)自父親?？梢?jiàn)，合子的染色體是由一套母本染色體與一套父本染色體組成。受精卵形成后，開(kāi)始卵裂、囊胚、原腸、器官原基形成、和器官發(fā)生等早期胚胎發(fā)育過(guò)程。在胚胎早期發(fā)育中，合子的基因組是關(guān)閉的，即不發(fā)生轉(zhuǎn)錄。在斑馬魚(yú)，這一過(guò)程維持到至少512-細(xì)胞期（卵裂期）。這一階段內(nèi)，胚胎的發(fā)育（卵裂）完全依靠卵子發(fā)生過(guò)程中存儲(chǔ)在卵母細(xì)胞中的物質(zhì)（如mRNA和蛋白質(zhì)。典型的如卵黃蛋白在胚胎早期發(fā)育中一直作為營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)提供能量，而rRNA則被分配到不同的胚胎細(xì)胞中用于組裝核糖體）。卵子攜帶的這些物質(zhì)被稱(chēng)為母源性物質(zhì)，其中的RNA被稱(chēng)為母源性RNA，也稱(chēng)母源性基因（注意與母源或母本基因相區(qū)別，母源或母本基因通常指的是母本染色體上的基因）。在斑馬魚(yú)胚胎中，胚胎本身基因組即合子基因組的轉(zhuǎn)錄要到胚胎發(fā)育至512-細(xì)胞時(shí)才能明顯觀測(cè)到，這些源自合子基因組上基因轉(zhuǎn)錄形成的基因表達(dá)產(chǎn)物被稱(chēng)為合子性基因產(chǎn)物，相應(yīng)的基因即稱(chēng)為合子型基因。合子型基因開(kāi)始轉(zhuǎn)錄的過(guò)程被稱(chēng)母源合子轉(zhuǎn)變過(guò)程（MZT: maternal-zygotic transition)。